DNA Edaran Ekstrakromosom Bebas Sel Urin: Kemungkinan Biomarker Untuk Penyakit Ginjal Kronis

May 12, 2023

KATA KUNCI

DNA bebas sel, penyakit ginjal kronis, circle-seq, diagnosis

Menurut studi yang relevan,cistancheadalah ramuan tradisional Cina yang telah digunakan selama berabad-abad untuk mengobati berbagai penyakit. Telah terbukti secara ilmiah untuk dimilikianti-inflamasi,anti-penuaan, Danantioksidanproperti. Penelitian telah menunjukkan bahwa cistanche bermanfaat bagi pasien yang menderitaginjalpenyakit. Bahan aktif cistanche dikenal untuk mengurangi peradangan,memperbaikiginjalfungsiDanmemulihkan sel ginjal yang rusak. Dengan demikian, mengintegrasikan cistanche dalam rencana perawatan penyakit ginjal dapat memberikan manfaat besar bagi pasien dalam mengelola kondisi mereka.Cistanchemembantu mengurangi proteinuria, menurunkan kadar BUN dan kreatinin, dan mengurangi risiko kerusakan ginjal lebih lanjut. Selain itu, cistanche juga membantu menurunkan kadar kolesterol dan trigliserida yang bisa berbahaya bagi pasien yang menderita penyakit ginjal.

cistanche lost empire

Klik Pada Cistanches Herba Untuk Penyakit Ginjal

Untuk info lebih lanjut:

david.deng@wecistanche.com WhatsApp:86 13632399501

DNA bebas sel yang bersirkulasi (cfDNA) yang mengambang di cairan tubuh adalah bidang penelitian yang intens mengingat potensi penggunaan klinisnya sebagai kelas biomarker penyakit invasif minimal untuk berbagai penyakit manusia. Meskipun diusulkan bahwa cfDNA terutama merupakan produk sampingan dari sel apoptosis (dengan kontributor utama adalah sel hematopoietik), juga disajikan bahwa pelepasan asam nukleat secara konstan adalah cara canggih pensinyalan antar sel selama pengembangan, remodeling epigenetik, regenerasi jaringan, dan penyesuaian sistem imun adaptif.1 Sampai saat ini, penelitian cfDNA sebagian besar terbatas pada molekul DNA linier yang terfragmentasi (< 200 base pairs [bp]). Recently, however, extrachromosomal circular DNAs (cDNAs) have gained considerable attention because of their ubiquitous prevalence in all eukaryotic cells. eccDNA is found in both physiological and pathological conditions, ranging from animals and plants to yeast sources, and has diverse origins. cDNAs are originated from and homologous to chromosomes, but once they are formed, they are likely to act independently. Although the formation and biological roles of eccDNA remain understudied, it is thought to reflect the genome's plasticity and instability.2 Similar to linear cf-DNA, eccDNA is demonstrated in human plasma and considered to be released into circulation after cell apoptosis/death and turnover, with a higher rate in diseased states. Due to their covalently bonded circular structure, extracellular eccDNAs are assumed to be more resistant to exonuclease degradation compared to their linear counterparts. Considerable research has been conducted on linear cf-DNA in blood, saliva, cerebrospinal fluid, and urine as an informative diagnostic tool3; however, the existence of eccDNA in human urine had not been discovered. In the recent issue of "Clinical and Translational Medicine", Lv et al. have demonstrated for the first time the presence of cell-free eccDNA (cf-eccDNA) in urine samples from healthy individuals and patients with advanced chronic kidney diseases (CKD).4 They analyzed urine samples from 28 healthy individuals and 21 patients with advanced CKD for characterization of urinary cf-eccDNA using a modified Circle-Seq method.

Lebih dari satu juta cf-eccDNA urin unik telah disajikan dari sampel sukarelawan yang sehat. Sebagai pengamatan yang menarik, penulis mengemukakan korelasi antara jumlah eccDNA dan gen penyandi protein, pulau CpG, elemen transposabel diselingi pendek, dan elemen berulang. Sebagian besar cf-eccDNA urin tercatat lebih kecil dari 1000 bp dan diperkaya dalam empat puncak utama yang diposisikan pada 207, 358, 553, dan 732 bp. Sementara sebagian besar kromosom manusia (14,9 persen ) berkontribusi pada pembentukan cf-eccDNA urin, kromosom yang kaya gen termasuk kromosom 17, 19, dan 20 berkontribusi paling tinggi, dan kromosom 21 yang miskin gen berkontribusi paling sedikit. Pengamatan ini dan laporan sebelumnya5,6 menyiratkan korelasi yang kuat antara aktivitas transkripsi dan pembentukan eccDNA.

cistanche pros and cons

Sementara beberapa fungsi biologis dan keadaan penyakit termasuk regulasi gen, resistensi obat, komunikasi sinyal, penuaan, dan tumorigenesis berhubungan dengan eccDNA,7 sedikit yang diketahui tentang bagaimana cf-eccDNA terbentuk. Oleh karena itu, pemahaman yang lebih baik tentang bagaimana eccDNA terbentuk memungkinkan kita untuk membuat alat diagnostik dan terapeutik baru. Sejalan dengan gagasan ini, Lv et al. disajikan bahwa sebagian besar (66,36 persen ) urutan pengulangan langsung (4- ke 18-bp) di dekat situs persimpangan eccDNA bersama dengan sepasang pengulangan trinucleotide palindromic dengan 4- bp "spacer" di antara mengapit situs awal dan akhir eccDNA. 4 Meskipun sebagian besar eccDNA berisi urutan pengulangan langsung dan pengulangan palindromik, menunjukkan kemungkinan keterlibatan sirkularisasi yang dimediasi rekombinasi homolog dan proses penggabungan akhir yang dimediasi mikrohomologi setelah DNA putus dan berkontribusi pada pemahaman kita tentang pembentukan eccDNA, sebagian besar eccDNA masih tidak mengandung pengulangan ini yang memerlukan kerja mekanistik lebih lanjut untuk sepenuhnya menjelaskan bagaimana/kapan fragmen DNA sirkular ini terbentuk.

Lebih menarik lagi, sementara karakterisasi cf-eccDNA urin serupa dalam hal ukuran, konten GC, dan tanda tangan motif antara individu sehat dan pasien, sampel dari pasien dengan CKD lanjut (stadium 3-5) menunjukkan tingkat cf-eccDNA urin yang lebih tinggi. dibandingkan dengan individu yang sehat. Meskipun ada perbedaan dalam parameter usia antara kelompok (pasien CKD relatif lebih tua), tidak ada korelasi yang ditemukan antara usia dan jumlah cf-eccDNA, mendukung hubungan yang kuat antara tingkat eccDNA dan keadaan CKD. Investigasi lebih lanjut tentang karakterisasi eccDNA dari pasien menunjukkan kelompok eccDNA miRNA yang sering terdeteksi pada pasien CKD. Sangat menarik bahwa gen penyandi miRNA yang diperkaya ini konsisten di seluruh pasien dan berhubungan dengan gangguan ginjal dan saluran kemih.8,9 Temuan ini sekarang memerlukan validasi melalui studi klinis kohort yang lebih besar yang mencakup tidak hanya pasien CKD dengan stadium lanjut tetapi juga CKD lainnya. tahap bersama dengan penyakit ginjal dan kemih lainnya. Menarik juga untuk menyelidiki berbagai penyakit non-kemih seperti kanker dan penyakit sel sabit, di mana cfDNA umumnya diteliti dan diterapkan sebagai alat diagnostik.

cistanche flaccid

Molekul DNA ini kemungkinan besar berasal dari ginjal, saluran kemih, serta plasma. Oleh karena itu, kadar cf-eccDNA urin yang lebih tinggi kemungkinan besar terjadi pada pasien dengan CDK yang diberikan apoptosis seluler ginjal yang lebih tinggi, kerusakan DNA, dan peradangan pada pasien ini. Meskipun banyak penelitian melaporkan adanya cf-eccDNA dalam cairan tubuh lainnya, penelitian ini mengusulkan satu kemungkinan mekanisme bagaimana DNA sirkular ini dibersihkan dari tubuh. Metode yang digunakan dalam penelitian ini tidak dapat membedakan eccDNA dari plasma atau saluran kemih, pengamatan ini dan rute pembersihan yang diusulkan untuk eccDNA plasma harus divalidasi dalam penelitian selanjutnya.

Lv dkk. memberikan laporan penelitian yang meyakinkan tentang laporan pertama tentang keberadaan eccDNA urin dan mengusulkan metode diagnostik potensial untuk CKD. Hasil ini menjanjikan untuk pengembangan uji biomarker non-invasif dan langsung tidak hanya untuk CDK tetapi mungkin untuk semua penyakit apoptosis lainnya (terutama penyakit ginjal dan saluran kemih). Seperti yang dilaporkan sebelumnya bahwa cf-DNA linier dalam sampel urin sangat terdegradasi,10 dan berbagai profil cf-eccDNA di antara pasien ditunjukkan dalam penelitian ini, penelitian lebih lanjut sangat diperlukan untuk menunjukkan stabilitas/keandalan DNA sirkular dalam urin dan penerapan metode deteksi sebagai alat diagnostik. Studi-studi ini harus diperluas ke pasien dengan stadium awal untuk mengeksplorasi potensi pencegahan kekambuhan penyakit, deteksi dini, stratifikasi risiko, pemilihan terapi yang optimal, dan pemantauan keberhasilan/respons pengobatan.

which cistanche is best

UCAPAN TERIMA KASIH

Penulis berterima kasih kepada Dr. Alexis Leonard atas komentarnya yang berharga pada artikel tersebut.

KONFLIK KEPENTINGAN

Penulis menyatakan bahwa tidak ada potensi konflik kepentingan.

REFERENSI

1. Ranucci R. Cell-free DNA: aplikasi pada berbagai penyakit. DNA bebas sel sebagai Penanda Diagnostik. Peloncat; 2019.
2. Nikolaev S, Santoni F, Garieri M, dkk. Mutasi driver ekstrachromosomal pada glioblastoma dan glioma tingkat rendah. Nat Komun. 2014;5:1–7.
3. Weerakoon KG, McManus DP. DNA bebas sel sebagai alat diagnostik untuk infeksi parasit manusia. Tren Parasitol. 2016;32:378–391.
4. Lv W, Pan X, Han P, dkk. Circle-Seq mengungkapkan ciri-ciri genomik dan spesifik penyakit dalam DNA sirkular ekstrakromosomal bebas sel urin. Klinik Transl Med. 2022;12:e817.
5. Henriksen RA, Jenjaroenpun P, Sjøstrøm IB, dkk. DNA sirkuler dalam germline manusia dan hubungannya dengan rekombinasi. Sel Mol. 2022;82:209–217.e27.
6. Møller HD, Mohiyuddin M, Prada-Luengo I, dkk. Elemen DNA sirkular yang berasal dari kromosom umum terdapat pada jaringan somatik manusia yang sehat. Nat Komun. 2018;9:1–12.
7. Ling X, Han Y, Meng J, dkk. DNA sirkular ekstrakromosom kecil (eccDNA): fungsi utama dalam evolusi dan kanker. Kanker Mol. 2021;20:1–15.
8. Kuscu C, Kiran M, Mohammed A, dkk. Analisis integratif dari RNA kecil yang bersirkulasi dan transkriptom cangkok ginjal pada glomerulopati transplantasi. Int J Mol Sci. 2021;22:6218.
9. Lee SI, Park H, Kim SJ, dkk. Beredar profil RNA dalam plasma pascareperfusi dari penerima transplantasi ginjal. Proses Transplantasi 2021;53:2853–2865.
10. Cheng TH, Jiang P, Tam JC, dkk. Pengurutan bisulfit genomewide mengungkapkan asal dan fragmentasi cfDNA urin yang tergantung waktu Klinik Biochem. 2017;50:496–501.

Untuk info lebih lanjut: david.deng@wecistanche.com WhatApp:86 13632399501

Anda Mungkin Juga Menyukai