Percobaan Acak Double-blind Cross-over Untuk Mempelajari Efek Prebiotik Pati Resisten pada Penyakit Ginjal Kronis (ReSPECKD) Bagian 2
May 26, 2023
Komite pemantauan keselamatan
Intervensi dalam uji coba ini berisiko rendah, dan merupakan tambahan dari perawatan standar yang akan terus diterima peserta selama masa uji coba dan setelah uji coba selesai; oleh karena itu, tidak ada data dan safety monitoring board (DSMB) yang akan dibentuk. Namun, akan ada tinjauan eksternal terhadap kimia klinis peserta dan setiap AE uji coba di titik tengah uji coba ketika semua peserta telah menyelesaikan periode pengobatan pertama mereka. Tinjauan ini akan dilakukan oleh ahli nefrologi dari luar Manitoba. Tinjauan ini akan memantau bukti bahaya pengobatan, mencari tren kimia klinis dan/atau peningkatan kejadian yang tidak diharapkan, terkait dengan pengobatan dan mengambil tindakan yang tepat. Tindakan ini mungkin termasuk mengusulkan perubahan protokol, mereka dapat mencakup penghentian uji coba lebih awal karena kerusakan pengobatan yang jelas tergantung pada hasil tinjauan.
Menurut penelitian yang relevan, cistanche adalah ramuan tradisional Tiongkok yang telah digunakan selama berabad-abad untuk mengobati berbagai penyakit. Telah terbukti secara ilmiah memiliki sifat anti-inflamasi, anti-penuaan, dan antioksidan. Penelitian telah menunjukkan bahwa cistanche bermanfaat bagi pasien yang menderita penyakit ginjal. Bahan aktif cistanche diketahui dapat mengurangi peradangan, memperbaiki fungsi ginjal dan memulihkan sel ginjal yang rusak. Dengan demikian, mengintegrasikan cistanche dalam rencana perawatan penyakit ginjal dapat memberikan manfaat besar bagi pasien dalam mengelola kondisi mereka. Cistanche membantu mengurangi proteinuria, menurunkan tingkat BUN dan kreatinin, dan mengurangi risiko kerusakan ginjal lebih lanjut. Selain itu, cistanche juga membantu menurunkan kadar kolesterol dan trigliserida yang bisa berbahaya bagi pasien yang menderita penyakit ginjal.

Klik pada manfaat rou cong rong
【Untuk info lebih lanjut: david.deng@wecistanche.com / WhatApp:86 13632399501】
Analisis statistik
Bioinformatika dan analisis statistik data microbiome akan dilakukan dengan bantuan Microbiome Insights dan platform Ilmu Data di CHI; itu akan diperbarui berdasarkan rekomendasi dan kemajuan teknologi antara sekarang dan pemrosesan sampel. Secara umum, pengaturan default dari FLASH assembler [22] akan digunakan untuk menggabungkan file cepat Illumina berpasangan-akhir yang tumpang tindih. Algoritma UPARSE [23] akan digunakan untuk (a) pemfilteran kualitas bacaan berdasarkan nilai kesalahan maksimum yang diharapkan=1.0, (b) identifikasi urutan unik, (c) penyortiran kelimpahan dan penghapusan lajang, (d) mengelompokkan bacaan ke dalam unit taksonomi operasional (OTU) berdasarkan ambang batas identitas 97 persen, (e) de novo dan pemeriksaan chimera berbasis referensi (terhadap database GOLD [22]), dan (f) pembangunan meja OTU. Klasifikasi taksonomi kemudian akan dilakukan menggunakan implementasi QIIME [26] dari UCLUST [24] dan akan diselaraskan dengan database Greengenes menggunakan algoritma PyNAST [25]. Pohon filogenetik dibangun dengan FastTree [27] untuk perbandingan lebih lanjut antara komunitas mikroba. Sebelum melakukan analisis downstream, tabel OTU yang dihasilkan akan disaring untuk menghapus semua sampel dengan kedalaman pengurutan yang rendah. Indeks kekayaan dan keanekaragaman komunitas kemudian akan dihitung menggunakan QIIME pada kedalaman tertentu per sampel. Filogenetik- (jarak UniFrac tertimbang) dan berbasis kelimpahan (perbedaan Bray-Curtis) - metrik keanekaragaman akan dihitung setelah normalisasi tabel OTU akhir menggunakan transformasi penskalaan penjumlahan kumulatif (CSS) [28]. Analisis koordinat utama (PCoA) akan diterapkan pada matriks jarak yang dihasilkan untuk menghasilkan plot dua dimensi menggunakan pengaturan default perangkat lunak PRIMER-6 (PRIMER-E Ltd, Plymouth). Analisis pengelompokan tanpa pengawasan akan dilakukan untuk menghubungkan pola pengelompokan sampel dengan proporsi OTU inti dalam setiap ceruk (OTU inti didefinisikan sebagai yang ada di setidaknya 75 persen sampel di setiap ceruk). Kelimpahan relatif dari OTU yang dipilih akan dinormalisasi di seluruh sampel. Perbedaan Bray-Curtis akan dihitung menggunakan paket R "vegan" [29], dan matriks yang dihasilkan akan mengalami pengelompokan hierarkis tanpa pengawasan menggunakan paket R "dendextend" [30] dan akan divisualisasikan selama heatmap matriks kelimpahan menggunakan paket R "complex-heatmap" [31]. Prosedur UNIVARIAT SAS akan digunakan untuk menguji normalitas residual untuk pengukuran -diversitas. Data yang terdistribusi tidak normal akan diubah menjadi log atau Box-Cox power dan kemudian dikenai uji analisis varians (ANOVA) menggunakan prosedur CAMPURAN SAS. Semua perbandingan berpasangan di antara kelompok akan diuji menggunakan penyesuaian rentang Tukey yang dipelajari. Analisis varians multivariat permutasi (PERMANOVA; diimplementasikan dalam perangkat lunak Primer6) akan digunakan untuk mendeteksi perbedaan yang signifikan antara metrik -diversitas komunitas mikroba. Kelimpahan relatif dari OTU inti yang dipilih akan diuji untuk hubungan yang signifikan secara statistik dengan metadata yang tersedia menggunakan analisis multivariat dengan pemodelan linier (MaAsLin) [32] memperhitungkan semua pembaur potensial (kovariat) yang dapat dikaitkan dengan profil mikrobioma (yaitu jenis kelamin, usia, BMI) dan peserta (diperlakukan sebagai faktor acak). Pengaitan yang signifikan akan dianggap di bawah ambang nilai 0,1. Untuk menilai pergeseran fungsi microbiome, analisis jaringan korelasi (CoNet, [33]) akan digunakan untuk mengeksplorasi hubungan co-occurrence/mutual exclusion mikroba dan mengidentifikasi OTU hub yang menunjukkan jumlah korelasi positif/negatif tertinggi dengan yang lain. OTU dalam kondisi perawatan.
Efek pengobatan pada hasil linier pada akhir setiap periode akan dianalisis dengan prosedur SAS CAMPURAN (SAS 9.4). Urutan dan jenis kelamin akan dimasukkan dalam model sebagai faktor tetap, dan partisipan akan dimasukkan sebagai faktor berulang. Normalitas distribusi data akan dilakukan dengan menggunakan uji Shapiro-Wilk, dan variabel yang tidak normal akan ditransformasikan sebelum dianalisis. Data demografis akan dilaporkan sebagai rata-rata ± standar deviasi. Hasilnya akan dilaporkan sebagai rata-rata kuadrat terkecil ± kesalahan standar rata-rata (SEM) kecuali ditentukan lain. Signifikansi statistik akan ditetapkan pada p < 0.05 untuk semua analisis. Platform Ilmu Data di CHI akan memberikan dukungan manajemen data selain dukungan biostatistik untuk proyek tersebut.
Pengacakan, penyamaran, dan pemecahan kode
Pasien yang memenuhi syarat (n=36) akan menjalani penilaian pada awal dan akan dialokasikan secara acak ke dalam 2 kelompok, masing-masing terdiri dari 18 peserta. Pengacakan akan dilakukan oleh peneliti independen dalam platform biostatistik di George and Fay Yee Center for Healthcare Innovation (CHI) di University of Manitoba. Pengacakan akan dilakukan dengan menggunakan kode yang ditulis dalam bahasa pemrograman statistik R (versi 3.5.3). Perawatan akan diberikan dengan rasio 1:1. Sebanyak 48 kartu pengacakan akan disiapkan, satu set berisi 24 kartu untuk setiap jenis kelamin. Jadwal pengacakan akan ditransfer ke dalam set amplop bersegel buram. Setelah kunjungan awal peserta, staf studi akan membuka amplop tertutup yang berisi alokasi peserta. Urutan intervensi tidak akan diketahui oleh peneliti dan peserta. Perawatan akan diberikan dalam sachet tertutup; isi sachet akan dibutakan oleh pihak luar, diberikan kepada staf studi berlabel A atau B, dan dibagikan kepada peserta sesuai masa pengobatannya. Perawatan tidak akan dibuka sampai analisis selesai kecuali diperlukan karena efek samping selama uji klinis. Juga akan ada tinjauan titik tengah dari data klinis peserta oleh ahli nefrologi independen yang tidak akan dibutakan (lihat bagian "Tanggung jawab penyelidik yang memenuhi syarat").
Perhitungan ukuran sampel
Ukuran sampel akhir dari 30 peserta dalam penelitian ini akan dapat mendeteksi perbedaan antara perlakuan dalam total p-kresol sulfat 17,5 μmol/L, atau perubahan ~ 15 persen, dengan kekuatan 0,88 (alpha {{6} },05, dua sisi), dengan korelasi orang dalam sebesar 0,79 [23] dan perkiraan standar deviasi 45 μmol/L [9] untuk p-kresol sulfat total. Penurunan zat terlarut uremik sebesar 30 persen atau lebih akan dianggap signifikan secara klinis, memerlukan uji coba tambahan yang menyelidiki intervensi prebiotik ini pada CKD, dan kami yakin kami dapat mendeteksi perubahan seperti itu jika terjadi. Untuk memperhitungkan hilangnya tenaga karena putus sekolah, kami akan merekrut 36 peserta.
Inklusi dalam analisis
Analisis utama akan dilakukan dengan menggunakan set analisis Semua Peserta (niat untuk mengobati). Analisis utama akan diulangi dalam set analisis Penyelesai. Demografi dan semua pengukuran dasar lainnya akan dianalisis di set Semua Peserta serta di set Penyelesai.
Kumpulan analisis pelengkap: semua peserta yang telah menyelesaikan uji coba.
Set analisis Semua Peserta: semua peserta acak.
Penghentian / penarikan peserta dari pengobatan percobaan
Setiap peserta memiliki hak untuk menarik diri dari sidang setiap saat. Peserta dapat menghentikan partisipasi uji coba kapan saja dan diminta untuk menghubungi anggota tim peneliti untuk memberi tahu mereka tentang keputusan mereka. Selain itu, peneliti dapat menghentikan peserta dari uji coba kapan saja jika peneliti menganggap perlu karena alasan apa pun termasuk kehamilan, tidak memenuhi syarat (baik yang timbul selama uji coba atau secara retrospektif telah diabaikan saat skrining), penyimpangan protokol yang signifikan, ketidaksesuaian yang signifikan. kepatuhan terhadap protokol, perkembangan penyakit yang mengakibatkan ketidakmampuan untuk terus mematuhi protokol, penarikan persetujuan dan mangkir.

Penarikan tidak akan mengakibatkan pengecualian data untuk peserta tersebut dari analisis. Karena analisis utama akan didasarkan pada niat-untuk-mengobati, juga akan ada analisis yang hanya melengkapi yang dilakukan.
Jika peserta ditarik dalam 4 minggu pertama uji coba, mereka akan diganti. Jika peserta pengganti ditarik, tidak akan ada penggantian berikutnya.
Alasan penarikan akan dicatat di CRF jika diberikan.
Remunerasi
Peserta akan dibayar $200 untuk setiap periode yang diselesaikan atau nilai prorata jika mereka mengundurkan diri dari uji coba. Setiap peserta akan menerima total $400 jika mereka menyelesaikan uji coba penuh.
Nama dan alamat peserta akan digunakan untuk menyiapkan, mencetak, mengirim surat, dan menyimpan catatan keuangan atau cek remunerasi. Perangko prabayar dan amplop akan diberikan kepada peserta dengan formulir yang membutuhkan tanda tangan mereka setelah menerima cek remunerasi. Peserta akan diminta mengembalikan formulir ke CDIC. Catatan ini akan disimpan selama maksimal 7 tahun.
Diskusi
CKD telah dikaitkan dengan perubahan ekologi mikroba usus, atau "dysbiosis", yang dapat berkontribusi pada perkembangan penyakit. Individu dan hewan dengan CKD menunjukkan perubahan besar dalam lingkungan usus termasuk perubahan komposisi mikroba, peningkatan pH tinja, dan peningkatan kadar metabolit yang berasal dari mikroba usus. Studi terbaru berfokus pada pendekatan diet untuk mengubah komposisi komunitas mikroba usus secara menguntungkan sebagai metode pengobatan untuk CKD. Pati resisten (RS), prebiotik yang mempromosikan proliferasi bakteri usus seperti Bifidobacteria dan Lactobacilli, meningkatkan produksi metabolit termasuk asam lemak rantai pendek, yang memberikan beberapa manfaat kesehatan. Studi dari model hewan dan individu dengan CKD menunjukkan bahwa suplementasi RS melemahkan konsentrasi zat terlarut retensi uremik, termasuk indoxyl sulfate dan p-cresol sulfate. Pati tipe 2 (HAMRS2) yang tahan serat makanan tinggi serat yang dapat difermentasi (HAMRS2) telah terbukti mengubah lingkungan usus pada model tikus CKD yang mengarah pada peningkatan fungsi ginjal yang nyata. RPS, yang merupakan pati resisten R2-, telah terbukti meningkatkan bakteri pengurai karbohidrat, seperti Bifidobacteria, dan menurunkan bakteri dengan aktivitas proteolitik, seperti E. coli [14, 17, 18]. RPS juga telah terbukti mengurangi konsentrasi racun uremik yang berasal dari mikrobioma usus pada babi [19]. Sementara penelitian pada hewan dan manusia yang melibatkan pati resisten telah menunjukkan kemampuan untuk mengubah mikrobiota usus dan mengurangi jumlah racun uremik, ada penelitian terbatas pada pasien CKD [14].
Dalam satu penelitian yang dilakukan pada individu dengan CKD yang sudah menjalani dialisis, diamati penurunan toksin uremik setelah konsumsi tepung jagung amilosa tinggi selama 6 minggu [20]. Tepung jagung tinggi amilosa adalah ~ 60 persen pati resisten berat kering, sedangkan RPS yang akan digunakan dalam proposal ini adalah ~ 70 persen pati resisten dan ~ 10 persen serat makanan lainnya [17]. Di sini, kami akan melakukan uji coba cross-over double-blind acak periode 2- untuk menyelidiki apakah konsumsi RPS sebagai terapi tambahan untuk standar perawatan CKD saat ini akan mengurangi toksin dan gejala uremik dengan mengubah mikrobiota usus pada pasien dengan CKD.
Hasil penelitian ini akan menambah bukti kemanjuran RPS pada pasien dengan CKD dan akan membentuk dasar uji coba terkontrol acak multisenter yang lebih besar yang menguji efek RPS pada penundaan perkembangan CKD dan inisiasi dialisis.
Manajemen data
Sumber data
Dokumen sumber adalah tempat data pertama kali direkam dan dari mana data CRF peserta diperoleh. Entri CRF akan dianggap sebagai data sumber jika CRF adalah tempat rekaman asli (misalnya tidak ada rekaman data tertulis atau elektronik lainnya). Semua dokumen akan disimpan dengan aman dalam kondisi rahasia. Pada semua dokumen khusus uji coba, selain formulir persetujuan yang ditandatangani, daftar induk, dan formulir remunerasi, peserta akan dirujuk dengan kode peserta uji coba, bukan dengan nama.
Akses ke data
Akses langsung akan diberikan kepada perwakilan resmi dari sponsor, lembaga tuan rumah, dan otoritas pengatur untuk mengizinkan pemantauan, audit, dan inspeksi terkait uji coba.
Pencatatan dan pencatatan data
Semua data uji coba akan dimasukkan dari kertas CRF atau dikumpulkan melalui platform REDCap University of Manitoba, dan dokumen sumber lainnya akan dimasukkan ke dalam database REDCap ini. Peserta akan diidentifikasi dengan nomor dan/atau kode khusus uji coba yang unik dalam basis data REDCap ini. Nama peserta dan informasi pengenal lainnya tidak akan dimasukkan dalam database REDCap, kecuali untuk formulir informed consent yang ditandatangani, formulir remunerasi, dan daftar induk studi. Alamat rumah dan email serta nomor telepon peserta akan dikumpulkan dan ditautkan ke ID studi dan nama peserta pada daftar master studi fisik/elektronik yang akan digunakan untuk mengoordinasikan kegiatan uji coba seperti pengiriman bahan studi ke rumah, cek remunerasi, dan komunikasi dengan peserta selama uji coba. Daftar master ini akan disimpan dalam lemari terkunci di CDIC atau di drive/komputer bersama yang dilindungi kata sandi di CDIC. Nama dan alamat peserta akan diberitahukan kepada petugas pengiriman atau kurir selama proses pengiriman, serta digunakan untuk pengiriman cek remunerasi bagi peserta yang tidak mengambil sendiri.
Data uji coba, tanpa mengidentifikasi informasi pribadi peserta, akan disimpan di lingkungan penelitian yang aman di University of Manitoba menggunakan REDCap. REDCap diimplementasikan secara lokal oleh platform Ilmu Data di George & Fay Yee Center for Healthcare Innovation di University of Manitoba. Kunjungan virtual studi akan dilakukan melalui platform Microsoft Teams University of Manitoba, yang merupakan layanan berbasis cloud yang dihosting secara eksternal. Data elektronik dengan informasi pribadi peserta yang mengidentifikasi, seperti nama dan informasi kontak, akan dilindungi kata sandi dan disimpan dalam file Excel di komputer di CDIC. Catatan elektronik dari formulir persetujuan yang ditandatangani akan disimpan di REDCap, serta disimpan di komputer aman yang dilindungi kata sandi/drive bersama di CDIC atau di lemari terkunci. Formulir persetujuan yang ditandatangani kertas akan disimpan dalam lemari terkunci di CDIC. Log studi lainnya akan diatur dalam pengikat yang kokoh dan disimpan di CDIC. CDIC diamankan 24 jam per hari dan memiliki akses terbatas.
Semua catatan penelitian percobaan akan disimpan selama 25 tahun. CRF kertas dan data sumber akan disimpan dalam wadah penyimpanan yang terkunci, terlepas dari informasi pengenal pribadi apa pun di CDIC. File kertas akan dibuang menggunakan metode penghancuran dokumen rahasia di CDIC.

Data elektronik akan dihapus identitasnya dan disimpan selama 10 tahun setelah studi berakhir. Data elektronik juga dapat dibagikan dalam bentuk yang tidak teridentifikasi dengan jurnal akademik untuk tujuan publikasi. Data dapat disimpan oleh jurnal akademik atau repositori akses terbuka lainnya di bawah kebijakan akses terbuka yang dapat digunakan oleh peneliti lain untuk analisis data lebih lanjut dan tujuan penelitian. File kertas akan dibuang menggunakan metode penghancuran dokumen rahasia.
Kriteria penghentian sidang
Uji coba akan dilanjutkan sampai semua peserta yang direkrut telah mencapai akhir masa tindak lanjut dan data telah dikumpulkan, diproses, dan dibersihkan. Tidak ada rencana penghentian lebih awal.
Prosedur akuntansi untuk data yang hilang, tidak terpakai, dan palsu
Jumlah dan proporsi nilai yang hilang akan didokumentasikan dalam laporan studi klinis. Nilai yang hilang tidak akan diperhitungkan kecuali dinyatakan lain. Analisis akan mengecualikan data dari peserta yang memiliki nilai yang hilang untuk variabel apa pun yang diperlukan untuk analisis.
Ketika data diamati tidak biasa dengan cara yang tidak dapat dijelaskan atau dinyatakan salah, analisis dapat diulangi setelah mengecualikan catatan yang terlibat. Analisis tambahan ini akan disajikan sebagai analisis sensitivitas.
Prosedur pelaporan setiap penyimpangan dari rencana statistik awal
Semua penyimpangan protokol yang didokumentasikan dalam database uji klinis akan ditabulasi (jika sesuai) dan dicantumkan dalam laporan studi klinis.
Pencatatan efek samping
Mengingat sifat dari intervensi, sangat tidak mungkin bahwa efek samping apapun akan terkait dengan uji coba. Namun, semua AE yang terjadi selama uji coba yang diamati oleh peneliti atau dilaporkan oleh peserta akan dicatat di CRF, terlepas dari intervensi uji coba atau tidak.
Informasi berikut akan dicatat: deskripsi, tanggal onset dan tanggal akhir, tingkat keparahan, dan penilaian keterkaitan dengan intervensi percobaan. Informasi tindak lanjut harus diberikan seperlunya. Jika ada efek samping yang dilaporkan, pasien akan ditawarkan untuk diperiksa pada kunjungan klinik berikutnya yang tersedia atau dalam 1 minggu, mana yang lebih awal, dan akan terus dipantau di klinik sampai AE teratasi.
Tingkat keparahan peristiwa akan dinilai pada skala berikut: 1=ringan, 2=sedang, dan 3=parah.
AE yang dianggap terkait dengan intervensi percobaan sebagaimana dinilai oleh penyelidik yang berkualifikasi akan diikuti sampai resolusi atau peristiwa tersebut dianggap stabil. Jika AE mengakibatkan penarikan dari uji coba, pasien yang ditarik karena reaksi pengobatan yang merugikan juga akan diikuti oleh klinik CKD sampai AE teratasi.
Pelaporan keselamatan
Tim studi akan melaporkan AE ke Health Canada dan kepala departemen/lembaga terkait dan University of Manitoba REB dengan menggunakan formulir pelaporan yang sesuai.
prosedur penjaminan mutu
Uji coba akan dilakukan dengan protokol yang disetujui saat ini, GCP, peraturan terkait, dan prosedur operasi standar.
Pemantauan rutin dapat dilakukan sesuai dengan GCP. Data dapat dievaluasi untuk kepatuhan dengan protokol dan keakuratan dokumen sumber. Mengikuti prosedur operasi standar tertulis, pemantau akan memverifikasi bahwa uji klinis dilakukan dan data dibuat, didokumentasikan, dan dilaporkan sesuai dengan protokol, GCP, dan persyaratan peraturan yang berlaku.
Singkatan
AE: Kejadian buruk; AR: Reaksi merugikan; PI: Penyidik kepala; CRA: Rekan penelitian klinis; CRF: Formulir laporan kasus; GCP: Praktik Klinis yang Baik; CT: Uji klinis; ICF: Formulir persetujuan yang diinformasikan; REB: Badan Etika Penelitian; SAE: Kejadian buruk yang serius; SOP: Prosedur operasi standar
Terima kasih
Kami ingin mengucapkan terima kasih dan berterima kasih kepada Michelle DiNella, Sarah Curtis, dan staf CDIC yang telah mendukung penyiapan uji coba ini.
Deklarasi Helsinki
Penyidik/QI akan memastikan bahwa persidangan ini dilakukan berdasarkan prinsip-prinsip Deklarasi Helsinki. NB. Deklarasi Helsinki 2008 memberikan perincian tentang apa yang harus dimasukkan dalam protokol: pendanaan, sponsor, afiliasi dan potensi konflik kepentingan, insentif untuk berpartisipasi, kompensasi atas kerugian, dan akses pascapercobaan ke obat-obatan dan perawatan.
Pelaporan
Penyelidik/QI harus menyerahkan Laporan Kemajuan Tahunan selama uji klinis setahun sekali kepada Dewan Etika Penelitian Kesehatan Universitas Manitoba. Selain itu, pemberitahuan Akhir Uji Coba akan diserahkan ke Dewan Etika Penelitian Kesehatan Universitas Manitoba dan Kesehatan Kanada.
Kerahasiaan peserta
Staf uji coba akan memastikan bahwa anonimitas peserta dipertahankan. Peserta akan diidentifikasi hanya dengan nomor ID peserta pada semua dokumen uji coba dan basis data elektronik apa pun kecuali untuk formulir persetujuan tertulis, daftar induk, dan formulir remunerasi. Semua dokumen akan disimpan dengan aman dan hanya dapat diakses oleh staf pengadilan dan personel yang berwenang. Uji coba akan mematuhi Undang-Undang Informasi Kesehatan Pribadi (PHIA) atau Undang-Undang Kebebasan Informasi dan Perlindungan Privasi (FIPPA) Manitoba.
Status percobaan
Uji coba ini diperkirakan akan mulai merekrut pada September 2021 dan berlanjut hingga sekitar Maret 2022. Nomor dan tanggal protokol saat ini adalah versi 3, 13 Juni 2021.

Komposisi, peran, dan tanggung jawab pusat koordinasi
PI (Dr. Mackay) dan rekan penyelidik (Drs. Tangri dan Mollard) akan bertanggung jawab atas pengawasan tersebut. Seorang mahasiswa PhD dan koordinator penelitian akan bekerja sama dalam menjalankan uji coba sehari-hari termasuk perekrutan, penyaringan, penjadwalan, kunjungan peserta, pengumpulan data, dan entri data. Ph.D. mahasiswa akan melapor langsung ke PI (Dr. Mackay), dan koordinator penelitian akan berhubungan setiap hari dengan rekan peneliti yang mengawasi mereka (Dr. Mollard). Seorang analis data akan bertanggung jawab untuk menganalisis data di bawah pengawasan Drs. Mackay dan Tangri. Proyek ini akan didiskusikan dengan tim peneliti CDIC secara keseluruhan selama pertemuan kelompok klinis setiap 2 minggu dan selama pertemuan dua mingguan dengan tim peneliti proyek untuk membahas rincian proyek tertentu.
Kontribusi penulis
MS membantu penyusunan naskah dan menyusun umpan balik dan perubahan dari penulis lain. KK membantu review naskah. HW mencari persetujuan etis dan berkontribusi pada manuskrip. RM, NT, dan DM merancang protokol penelitian dan kriteria seleksi peserta, mencari dana dan persetujuan etis, membantu revisi naskah, dan meninjau ulang naskah. Semua penulis berkontribusi, membaca, membuat revisi kritis, dan menyetujui naskah akhir sebelum diserahkan.
Pendanaan
Uji coba ini didanai oleh Weston Family Microbiome Initiative dan Pusat Inovasi Penyakit Kronis di Rumah Sakit Seven Oaks. Produk perawatan yang digunakan dalam uji coba ini disediakan oleh MSPrebiotic Inc. secara gratis. Penyandang dana tidak akan terlibat dalam rancangan uji coba, pelaksanaan, analisis data, atau publikasi. Sponsor uji coba ini adalah University of Manitoba, di mana Dylan MacKay adalah narahubungnya.
Ketersediaan data dan bahan
Publikasi yang dihasilkan dari uji coba ini akan mengikuti rekomendasi ICMJE untuk kepenulisan. Hasil uji coba ini akan dipublikasikan dalam publikasi peer-review dan dapat dipresentasikan di konferensi. Hasil ringkasan dari penelitian ini akan diunggah ke pendaftaran percobaan ClinicalTrials.gov. Data yang tidak teridentifikasi akan tersedia bagi peneliti lain untuk kegiatan sintesis pengetahuan atas permintaan yang masuk akal.
Deklarasi
Persetujuan etika dan persetujuan untuk berpartisipasi
Badan Etika Penelitian Biomedis Kampus Bannatyne (BREB) di Winnipeg, Manitoba, Kanada, telah menyetujui protokol penelitian ini (HS23161 (B2019:089). Semua perubahan pada protokol penelitian ini ditinjau dan disetujui oleh U of M BREB, dan perubahan pada protokol diperbarui di ClinicalTrials.gov. Health Canada telah mengeluarkan Pemberitahuan Otorisasi untuk uji coba ini (No. File 250522). Peserta harus secara pribadi menandatangani dan memberi tanggal versi terbaru yang disetujui dari formulir persetujuan sebelum prosedur khusus uji coba dilakukan Uji coba ini terdaftar di ClinicalTrials.gov (NCT04961164).
Persetujuan untuk publikasi
Semua peserta akan memberikan persetujuan untuk mempublikasikan atau menyajikan informasi yang dikumpulkan selama persidangan dengan cara di mana informasi pengenal pribadi mereka seperti nama, alamat, dan nomor telepon tidak diungkapkan.
Kepentingan yang bersaing
Semua penulis lain menyatakan bahwa mereka tidak memiliki kepentingan bersaing.
Detail Penulis
1 Pusat Inovasi Penyakit Kronis, Rumah Sakit Umum Seven Oaks, Winnipeg, MB, Kanada. 2 Departemen Ilmu Gizi Manusia, Universitas Manitoba, Winnipeg, MB, Kanada. 3 Departemen Ilmu Kesehatan Masyarakat, Universitas Manitoba, Winnipeg, MB, Kanada. 4 Fakultas Kedokteran Max Rady, Universitas Manitoba, Winnipeg, MB, Kanada.
Referensi
1. Arora P, Vasa P, Brenner D, Iglar K, McFarlane P, Morrison H, dkk. Perkiraan prevalensi penyakit ginjal kronis di Kanada: hasil survei perwakilan nasional. CMAJ. 2013;185(9):E417–23.
2. Ng JK, Li PK. Epidemi penyakit ginjal kronis: bagaimana kita menghadapinya? Nefrologi (Carlton). 2018;23(Sup 4):116–20. PMID: 30298662.
3. Fujii H, Kono K, Nishi S. Karakteristik penyakit arteri koroner pada penyakit ginjal kronis. Klin Exp Nephrol. 2019;23(6):725–32.
4. Collister D, Ferguson T, Komenda P, Tangri N. Pola, faktor risiko, dan prediksi perkembangan penyakit ginjal kronis: tinjauan naratif. Semin Nephrol. 2016;36(4):273–82. PMID: 27475658.
5. Beaudry A, Ferguson TW, Rigatto C, Tangri N, Dumanski S, Komenda P. Biaya terapi dialisis dengan modalitas di Manitoba. Jurnal Klinis Perhimpunan Nefrologi Amerika. 2018;13(8):1197–203. PMID: 30021819.
6. Aronov PA, Luo FJG, Plummer NS, Quan Z, Holmes S, Hostetter TH, dkk. Kontribusi kolon untuk zat terlarut uremik. J Am Soc Nephrol. 2011;22(9):1769– 76. PMID: 21784895.
7. Ramezani A, Massy ZA, Meijers B, Evenepoel P, Vanholder R, Raj DS. Peran mikrobioma usus dalam uremia: target terapi potensial. Jurnal Penyakit Ginjal Amerika. 2016;67(3):483–98. PMID: 26590448.
8. Simonsen E, Komenda P, Lerner B, Askin N, Bohm C, Shaw J, dkk. Pengobatan pruritus uremik: tinjauan sistematis. Am J Kidney Dis. 2017; 70(5):638–55. PMID: 28720208.
9. Meijers BK, dkk. P-Cresol dan risiko kardiovaskular pada penyakit ginjal ringan hingga sedang. Klinik J Am Soc Nephrol. 2010;5(7):1182–9. PMID: 20430946.
10. Gao H, Liu S. Peran toksin uremik indoksil sulfat dalam perkembangan penyakit kardiovaskular. Ilmu kehidupan. 2017;185:23–9. PMID: 28754616.
11. Lisowska-Myjak B. Racun uremik dan pengaruhnya terhadap banyak sistem organ. Praktek Klinik Nefron. 2014;128(3-4):303–11. PMID: 25531673.
12. Schulman G, Berl T, Beck GJ, Remuzzi G, Ritz E, Arita K, dkk. Uji coba EPPIC terkontrol plasebo acak dari AST-120 pada CKD. J Am Soc Nephrol. 2015; 26(7):1732–46. PMID: 25349205.
13. Hung SC, Kuo KL, Wu CC, Tarng DC. Indoxyl sulfate: faktor risiko kardiovaskular baru pada penyakit ginjal kronis. Jurnal Asosiasi Jantung Amerika. 2017;6(2):e005022. PMID: 28174171.
14. Snelson M, Kellow NJ, Coughlan MT. Modulasi mikrobiota usus oleh pati resisten sebagai pengobatan penyakit ginjal kronis: bukti kemanjuran dan wawasan mekanistik. Adv Nutr. 2019;10(2):303–20. PMID: 30668615.
15. Birkett A, Muir J, Phillips J, Jones G, O'Dea K. Tahan pati menurunkan konsentrasi feses amonia dan fenol pada manusia. Am J Clin Nutr. 1996; 63(5):766–72. PMID: 8615362.
16. Smith EA, Macfarlane GT. Pencacahan bakteri kolon manusia yang memproduksi senyawa fenolik dan indolik: efek pH, ketersediaan karbohidrat, dan waktu retensi pada metabolisme asam amino aromatik disimilasi. J Appl Bakteriol. 1996;81(3):288–302. PMID: 8810056.
17. Alfa MJ, Strang D, Tappia PS, Graham M, van Domselaar G, Forbes JD, dkk. Uji coba acak untuk menentukan dampak komposisi pati yang tahan pencernaan pada mikrobioma usus pada orang dewasa yang lebih tua dan paruh baya. Klinik Nutr. 2018;37(3):797–807.
18. Baxter NT, Schmidt AW, Venkataraman A, Kim KS, Waldron C, Schmidt TM, dkk. Dinamika mikrobiota usus manusia dan asam lemak rantai pendek sebagai respons terhadap intervensi diet dengan tiga serat yang dapat difermentasi. MBio. 2019. PMID: 30696735;10(1):e02566–18.
19. Losel D, Claus R. Efek ketergantungan dosis dari pati kentang resisten dalam makanan pada pembentukan skatole usus dan akumulasi jaringan adiposa pada babi. J Vet Med A Physiol Pathol Clin Med. 2005;52(5):209–12. PMID: 15943603.
20. Sirich TL, Plummer NS, Gardner CD, Hostetter TH, Meyer TW. Efek peningkatan serat makanan pada kadar plasma zat terlarut yang berasal dari usus besar pada pasien hemodialisis. Klinik J Am Soc Nephrol. 2014;9(9):1603–10. PMID: 25147155.
21. Pretorius CJ, McWhinney BC, Sipinkoski B, Johnson LA, Rossi M, Campbell KL, dkk. Rentang referensi dan variasi biologis indoksil serum bebas dan total serta p-kresil sulfat diukur dengan metode deteksi fluoresensi UPLC cepat. Klinik Chim Acta. 2013;419:122–6. PMID: 23428591.
22. Magoc T, Salzberg SL. FLASH: penyesuaian panjang bacaan pendek yang cepat untuk meningkatkan rakitan genom. Bioinformatika. 2011;27(21):2957–63. PMID: 21903629.
23.Edgar RC. UPARSE: urutan OTU yang sangat akurat dari bacaan amplikon mikroba. Metode Nat. 2013;10(10):996–8. PMID: 23955772.
24.Edgar RC. Pencarian dan pengelompokan urutan besarnya lebih cepat daripada BLAST. Bioinformatika. 2010;26(19):2460–1. PMID: 20709691.
25. Caporaso JG, Bittinger K, Bushman FD, DeSantis TZ, Andersen GL, Knight R. PyNAST: alat yang fleksibel untuk menyelaraskan urutan ke penyelarasan template. Bioinformatika. 2010;26(2):266–7. PMID: 19914921.
26. Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, Costello EK, dkk. QIIME memungkinkan analisis data pengurutan komunitas throughput tinggi. Metode Nat. 2010;7(5):335–6. PMID: 20383131.
27. Harga MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree 2 – kira-kira pohon dengan kemungkinan maksimum untuk keberpihakan besar. PLOS SATU. 2010;5(3):e9490. PMID: 20224823.
28. Paulson JN, Stine OC, Bravo HC, Pop M. Analisis kelimpahan diferensial untuk survei gen penanda mikroba. Metode Alam. 2013;10(12):1200. PMID: 24076764–2.
29. Jari Oksanen FGB, Friendly M, Kindt R, Legendre P, McGlinn D, Minchin PR, dkk. Paket vegan, dalam paket ekologi Komunitas; 2019.
30. Galili T. dendextend: paket R untuk memvisualisasikan, menyesuaikan, dan membandingkan pohon pengelompokan hierarkis. Bioinformatika. 2015;31(22):3718–20. PMID: 26209431.
31. Peta panas Gu Z, Eils R, Schlesner M. Kompleks mengungkapkan pola dan korelasi dalam data genomik multidimensi. Bioinformatika. 2016;32(18): 2847–9. PMID: 27207943.
32. Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV, dkk. Disfungsi mikrobioma usus pada penyakit radang usus dan pengobatannya. Genom Biol. 2012;13(9):R79. PMID: 23013615.
33. Faust K, Sathirapongsasuti JF, Izard J, Segata N, Gevers D, Raes J, dkk. Hubungan co-occurrence mikroba dalam microbiome manusia. Biol Komputasi PLoS. 2012;8(7):e1002606. PMID: 22807668
Catatan PenerbitSpringer Nature tetap netral sehubungan dengan klaim yurisdiksi dalam peta yang diterbitkan dan afiliasi kelembagaan.
【Untuk info lebih lanjut: david.deng@wecistanche.com / WhatApp:86 13632399501】






