Tinjauan Pengujian Genetik pada Pasien Penyakit Ginjal: Hasil Diagnostik Varian Nukleotida Tunggal Dan Variasi Jumlah Salinan Dievaluasi Di Seluruh Dan Dalam Kelompok Fenotipe Ginjal

AbstrakPenyakit ginjal genetikterdiri dari berbagai kelompok kelainan. Ini secara kasar dapat dibagi menjadi kelompok fenotipe anomali kongenitalginjal dan saluran kemih, ciliopati, glomerulopati, kelainan batu, penyakit ginjal tubulointerstitial, dan tubulopati. Banyak etiologi yang dapat menyebabkan penyakit ginjal kronis yang dapat berkembang menjadi penyakit ginjal stadium akhir. Meskipun masing-masing penyakit jarang terjadi, kelainan genetik ini menyebabkan sebagian besar kasus penyakit ginjal. Dengan diperkenalkannya pengurutan paralel secara besar-besaran, pengujian genetik menjadi lebih mudah diakses, namun analisis komprehensif mengenai hasil diagnostik masih kurang. Tinjauan ini memberikan gambaran hasil diagnostik pengujian genetik di seluruh dan dalam seluruh fenotip penyakit ginjal melalui pencarian literatur sistematis yang menghasilkan 115 artikel yang disertakan. Karakteristik pasien, tes, dan kohort yang dapat mempengaruhi hasil diagnostik disorot. Deteksi variasi jumlah salinan dan kontribusinya terhadap hasil diagnostik dijelaskan untuk semua kelompok fenotip. Selain itu, dampak diagnosis genetik pada pasien dan anggota keluarga, yang dapat bersifat diagnostik,terapeutik, dan prognostik, ditunjukkan melaluitermasuk artikel. Tinjauan ini akan memungkinkan dokter untuk memperkirakan kemungkinan apriori dalam menemukan penyebab genetik penyakit ginjal pada pasien mereka.

KATA KUNCI:penyakit ginjal kronik, CNV,hasil diagnostik, pengujian genetik, MPS, nefrogenesis, review

KLIK DI SINI UNTUK MENGETAHUI CISTANCHE UNTUK PENGOBATAN CKD

1|PERKENALAN

Penyakit ginjal genetikmembentuk kelompok kelainan yang heterogen, yang meskipun secara individual jarang terjadi, namun secara bersama-sama sering terjadi dan penting untuk ditegakkan (Groopman et al., 2019). Mengidentifikasi penyebab genetik pada pasien penyakit ginjal sangat penting bagi pasien dan anggota keluarganya. Bagi pasien, diagnosis genetik dapat memberikan pengetahuan tentang etiologi, pengobatan yang dipersonalisasi, dan kemungkinan untuk mendapatkan nasihat tentang prognosis dan pilihan keluarga berencana. Anggota keluarga dapat diberi konseling tentang pilihan tes dan skrining tanpa gejala. Diagnosis genetik juga penting untuk donasi ginjal yang berhubungan dengan kehidupan. Berbagai kategori penyakit ginjal genetik dapat dibedakan (Hildebrandt, 2010). Gambaran klinis yang penting adalah penyakit ginjal kronis (CKD) yang dapat berkembang menjadi penyakit ginjal stadium akhir (ESKD), yang memiliki beban penyakit yang tinggi (Coresh, 2017). Banyak etiologi yang dapat menyebabkan titik akhir umum ini (Groopman et al., 2019). Secara keseluruhan, pada penyakit ginjal genetik, varian patogen pada beberapa gen dapat menyebabkan satu fenotipe (heterogenitas genetik), dan varian patogen pada gen tertentu dapat memiliki beberapa presentasi klinis (pleiotropi) (Stokman et al., 2016).

Pengenalan pengurutan paralel masif (MPS), yang sebelumnya disebut sebagai pengurutan generasi berikutnya, telah membuat pengujian penyakit ginjal monogenik (MKD) lebih mudah diakses dan oleh karena itu diagnosis MKD menjadi lebih mudah. Hal ini telah menghasilkan banyak wawasan baru, namun analisis komprehensif mengenai hasil diagnostik di seluruh dan di dalam fenotip masih kurang. Memperkirakan kemungkinan hasil diagnostik dari pengujian genetik, pada pasien tertentu, sangat penting untuk menentukan kemungkinan diagnosis penyakit monogenik saat melakukan pengujian genetik. Perkiraan hasil ini, bersama dengan faktor-faktor seperti biaya, ketersediaan, tetapi juga kebutuhan spesifik pasien dan/atau orang tua terkait dengan misalnya keluarga berencana atau donasi ginjal terkait kehidupan, menjadi masukan bagi pengambilan keputusan bersama sehubungan dengan pengujian genetik. Berbagai penelitian melaporkan hasil diagnostik yang bervariasi dari pengujian genetik untuk fenotip penyakit ginjal yang berpotensi bersifat genetik. Beragamnya hasil diagnostik yang dilaporkan mungkin disebabkan oleh perbedaan dalam (a) karakteristik pasien, (b) karakteristik tes genetik, dan/atau (c) karakteristik kohort. Faktor pasien yang dapat mempengaruhi hasil diagnostik adalah riwayat keluarga yang positif, gambaran ekstrarenal, gejala sindrom, dan penyakit yang parah, termasuk timbulnya penyakit secara dini dan adanya ESKD (Knoers et al., 2022). Karakteristik pengujian yang dapat mempengaruhi hasil yang dilaporkan adalah jumlah gen yang dianalisis (meluas ke semua gen [exome] atau seluruh genom secara maksimal), apakah variasi jumlah salinan (CNV) dinilai, apakah pengujian tambahan dilakukan untuk wilayah genom yang sulit ( misalnya, MUC1 dan ekson 1 dari PKD1), tetapi juga apakah analisis trio (anak dan kedua orang tua diuji) dan segregasi dilakukan untuk klasifikasi varian tambahan. Selain itu, hal-hal spesifik dari kelompok tersebut juga dapat menjadi hal yang penting. Dalam kohort klinis (kasus berturut-turut), fenotipnya seringkali kurang homogen, dan populasinya mungkin lebih mewakili pasien yang datang ke kliniknya sendiri. Dalam kohort penelitian, berbagai kriteria inklusi dan eksklusi diterapkan, pasien sering kali merupakan kasus terpilih, sebagian besar dicurigai menderita diagnosis genetik, dari banyak pusat, dan hasil diagnostik tidak selalu dapat digeneralisasikan ke lingkungan diagnostik. Variabel lain yang relevan mungkin adalah ukuran kelompok.

Dalam tinjauan ini, kami bertujuan untuk menentukan hasil diagnostik tes genetik di dalam dan di seluruh rangkaian fenotipe penyakit ginjal genetik yang potensial. Karakteristik pasien, tes, dan kohort yang mempengaruhi berbagai hasil disorot. Kami memberikan gambaran rinci dan berbeda yang dapat membantu mempertimbangkan makna dari berbagai publikasi, dengan informasi yang berpotensi berguna untuk praktik klinis. Kami juga menyoroti dampak klinis dari diagnosis genetik berdasarkan penelitian yang dikumpulkan dan kami menunjukkan bagaimana pendekatan pengujian genetik telah berkembang selama bertahun-tahun.

TABEL 1 Kumpulan istilah yang digunakan untuk melakukan pencarian PubMed j Kumpulan (1) dan (2) digabungkan menjadi satu pencarian menggunakan operator Boolean "DAN", hal yang sama juga dilakukan untuk Kumpulan (1) dan (3) Kumpulan Istilah di judul/abstrak

(1) Ginjal ATAU Ginjal ATAU Alport ATAU ADPKD ATAU ARPKD ATAU CAKUT ATAU ciliopati ATAU nefronofthisis ATAU nefrol* ATAU nefron* ATAU nefrogenik ATAU glomeruli* ATAU urol* ATAU saluran kemih ATAU tubulopati* ATAU nefrotik

(2) Hasil diagnostik ATAU hasil ATAU tes genetik ATAU WES ATAU WGS ATAU sekuensing seluruh exome ATAU sekuensing seluruh exome ATAU seluruh exome ATAU seluruh genom ATAU seluruh-exome ATAU seluruh genom ATAU panel gen ATAU panel gen ATAU panel multigene ATAU panel multigene ATAU sekuensing seluruh genom ATAU MPS ATAU sekuensing paralel masif ATAU sekuensing paralel masif ATAU NGS ATAU sekuensing generasi berikutnya ATAU sekuensing generasi berikutnya ATAU sekuensing eksomik ATAU sekuensing genom ATAU sekuens gen yang ditargetkan* ATAU sekuens yang ditargetkan* ATAU panel yang ditargetkan*

(3) CNV ATAU varian nomor salinan ATAU variasi nomor salinan ATAU varian nomor salinan ATAU larik SNP ATAU larik SNP ATAU larik-CGH ATAU larik CGH

2|METODE

2.1|Seleksi studi

Pencarian literatur sistematis dilakukan untuk menjawab pertanyaan tinjauan: "Apa hasil diagnostik dari pengujian genetik pada segala jenis penyakit ginjal dan karakteristik pasien, kohort, dan tes apa yang berdampak pada hasil diagnostik?" Ulasan ini tidak terdaftar dalam database ulasan. Basis data PubMed dicari pada tanggal 2 April 2021, menggunakan istilah yang ditampilkan pada Tabel 1. Dua reviewer secara independen memilih artikel berdasarkan kriteria inklusi yang telah ditentukan menggunakan Rayyan (Ouzzani, Hammady, Fedorowicz, & Elmagarmid, 2016). Perbedaan pendapat diselesaikan melalui konsensus atau dengan bantuan peninjau ketiga.

Semua kriteria inklusi ini bersifat wajib: (a) artikel asli yang diterbitkan dalam 10 tahun terakhir, (b) partisipan manusia, (c) hasil diagnostik dari pengujian genetik yang dilaporkan atau dapat dikurangkan, (d) pasien menderita penyakit ginjal, dan (e ) kohort dari setidaknya 30 pasien yang tidak terkait. Artikel yang berfokus pada kanker ginjal dikeluarkan. Artikel tambahan diidentifikasi dan dimasukkan secara snowballing.

2.2|Ekstraksi data

Ekstraksi data dilakukan menggunakan bidang data yang telah ditentukan sebelumnya. Studi dikelompokkan dalam kelompok fenotip penyakit ginjal berikut: penyakit ginjal tubulointerstitial dominan autosomal (ADTKD), anomali kongenital ginjal dan saluran kemih (CAKUT), ciliopathies (dibagi dalam penyakit ginjal polikistik autosomal dominan [ADPKD] dan ciliopathies lainnya/campuran) , glomerulopati (sindrom nefrotik [NS] dan lainnya/campuran), nefrolitiasis/urolitiasis, tauopati, ESKD, dan fenotip penyakit ginjal campuran. Untuk semua studi, detailnya.

diekstraksi berdasarkan karakteristik pasien, karakteristik kohort, dan tes genetik yang dilakukan. Rincian kohort yang diekstraksi adalah jumlah pasien yang dimasukkan, fenotipe, dan jenis kohort (kohort klinis atau kohort penelitian). Sebuah kohort dianggap sebagai kohort klinis jika kohort tersebut berasal dari lingkungan klinis yang didefinisikan dengan jelas (misalnya, semua pasien berturut-turut yang menerima transplantasi ginjal) dan/atau melaporkan hasil pengujian genetik dari lingkungan diagnostik (misalnya, semua pasien yang dirujuk untuk mendapatkan gen pengujian panel). Karakteristik pasien yang diekstraksi meliputi: persentase kasus keluarga, persentase kekerabatan, persentase kasus dengan gejala ekstrarenal, usia timbulnya penyakit, dan persentase penderita ESKD. Untuk tes genetik, rincian yang diekstraksi mencakup: jumlah gen yang disaring dan apakah analisis varian nukleotida tunggal (SNV) dan/atau CNV dilakukan. Analisis CNV dianggap dilakukan, juga jika hanya satu gen yang dinilai. CNV didefinisikan di sini sebagai penghapusan atau duplikasi yang terlalu besar untuk dapat ditangkap oleh pengurutan tradisional. Jenis tes genetik (misalnya, panel multigen berbasis MPS, susunan polimorfisme nukleotida tunggal [SNP], pengurutan seluruh exome [WES], pengurutan seluruh genom [WGS], dll.), termasuk jenis analisis CNV diekstraksi. Hasil diagnostik diadopsi dari makalah atau dihitung dari data. Kemungkinan varian patogen dan varian patogen dimasukkan dalam hasil diagnostik kecuali rincian klasifikasi varian tidak ditentukan oleh penulis. Dalam hal ini, hasil yang dilaporkan oleh penulis diekstraksi. Jika penulis menggunakan istilah yang menyimpang untuk menggambarkan varian (yaitu, istilah lain selain [kemungkinan] patogen, misalnya, "mungkin menyebabkan penyakit" atau "berpotensi patogen") istilah ini dan hasil yang terkait akan diekstraksi. Kriteria yang digunakan untuk menilai varian di setiap artikel juga dicatat. Gen kandidat tidak dimasukkan dalam hasil diagnostik, namun disorot dalam kategori "patut diperhatikan". Hasil diagnostik dihitung dan dicatat per fenotipe dalam kelompok dengan fenotipe campuran. Ketika rincian tersedia mengenai kohort asal populasi yang diuji, hasil diagnostik yang diekstrapolasi ke kohort yang lebih besar juga dihitung (misalnya, ketika subkelompok pasien transplantasi tertentu diuji secara genetik, hasil diagnostik diekstrapolasi ke seluruh kelompok). kelompok pasien transplantasi). Jika dilaporkan, persentase kasus dengan varian yang signifikansinya tidak diketahui akan diekstraksi. Kami juga menghitung hasil hanya berdasarkan CNV dan menentukan berapa persentase hasil diagnostik yang dilaporkan dapat dijelaskan oleh CNV. Ketika penelitian melaporkan karakteristik pasien yang berdampak positif pada hasil diagnostik, hal ini dicatat. Detail tambahan apa pun yang relevan juga diambil. Terakhir, kami menetapkan jumlah gen yang bertanggung jawab atas 50% hasil diagnostik teratas. Gen yang bertanggung jawab dicatat kecuali gen hanya bertanggung jawab atas satu kasus positif dan/atau beberapa gen yang dijadikan persentase akhir.

2.3|Visualisasi data

Data dirangkum dengan menggabungkan karakteristik kohort, pasien, dan tes serta hasil hasil diagnostik per kelompok fenotip dalam tabel ringkasan. Gambaran lebih rinci dari semua penelitian dirangkum dalam tabel terpisah per kelompok penyakit. Kami pertama kali melihat karakteristik pasien yang berdampak positif terhadap hasil diagnostik dalam satu penelitian dan menggambarkannya dalam tabel ringkasan. Selanjutnya, kami menilai dampak karakteristik pasien, kohort, dan tes antara berbagai penelitian. Untuk memvisualisasikan pengaruh karakteristik tersebut dibuat plot sebar, plot kotak, dan diagram lingkaran dengan menggunakan SPSS (versi 26, IBM, New York, NY) untuk melihat hubungan antara dua variabel kuantitatif dalam satu penelitian, di semua penelitian. Untuk menghindari interpretasi berlebihan terhadap data yang diperoleh dari penelitian yang sangat bervariasi, kami memutuskan untuk hanya menampilkan representasi visual dari data dan tidak melakukan uji statistik.

3|HASIL

Pencarian PubMed menghasilkan 5.361 makalah. Setelah disaring judul, abstrak, dan teks lengkap, tersisa 98 makalah yang memenuhi kriteria inklusi. Tujuh belas artikel juga diidentifikasi dan dimasukkan melalui snowballing.

Tabel 2 memberikan gambaran hasil panen yang dilaporkan per kelompok penyakit. Per kelompok penyakit, 4 hingga 25 artikel dimasukkan dengan karakteristik pasien, tes, dan kohort yang bervariasi per penelitian. Hasil diagnostik sangat berbeda di setiap kelompok penyakit dan di antara kelompok penyakit yang berbeda (Tabel 2; Gambar 1a). Kami menemukan hasil diagnostik terendah pada kelompok penyakit CAKUT dan hasil diagnostik tertinggi pada kelompok ciliopati dan dalam kelompok ini hasil yang lebih tinggi lagi untuk kelompok ADPKD. Namun, pada kelompok penyakit CAKUT, kami menemukan hasil diagnostik tertinggi hanya berdasarkan CNV (Gambar 1b). Ketika kita melihat hasil panen yang diekstrapolasi ke kelompok yang lebih besar, kita sering menemukan hasil yang lebih rendah dari yang dilaporkan pada awalnya, seperti yang kita perkirakan (Tabel 2). Nilai-nilai ini mewakili hasil diagnostik minimum untuk populasi asal.

Pada Tabel Tambahan 1, kelompok penyakit disajikan secara lebih rinci. Karakteristik pasien, kohort, dan tes, termasuk rincian yang perlu diperhatikan, dijelaskan per studi individual. Ketika tersedia hasil diagnostik per fenotip (terutama pada Tabel Tambahan 1h yang mencakup fenotip penyakit ginjal campuran) dan hasil diagnostik yang diekstrapolasi ke populasi asal yang lebih besar dimasukkan.

Lima penelitian melaporkan populasi ESKD yang masuk daftar tunggu untuk operasi transplantasi atau telah menerima transplantasi ginjal (Tabel Tambahan 1g). Hasil diagnostik dalam penelitian ini berkisar dari 0,5% (hanya penghapusan gen penuh pada 20 gen yang dinilai) hingga 50,9% pada pasien yang diuji secara genetik pada saat penelitian dilakukan. Ketika mengekstrapolasi hal ini ke kelompok pasien transplantasi ginjal (daftar tunggu) yang diekstrapolasi, hasilnya berkisar antara 12,5 hingga 24,6%.

Sepuluh penelitian dari berbagai kelompok penyakit melaporkan penyakit ginjal yang tidak diketahui asalnya (pasien yang fenotipe klinisnya tidak menunjukkan diagnosis spesifik). Kelompok fenotipe terdiri dari ADTKD (1), ESKD (3), dan fenotipe penyakit ginjal campuran (6). Hasil diagnostik pada populasi pasien dengan nefropati familial yang penyebabnya tidak diketahui, diselidiki untuk ADTKD, adalah 29,5%. Dalam penelitian yang menyelidiki ESKD dengan etiologi yang belum terpecahkan, hasil diagnostik berkisar antara 11,6 hingga 44,4%. Dalam enam penelitian dengan fenotip penyakit ginjal campuran, hasil pada pasien dengan nefropati yang tidak diketahui asalnya berkisar antara 17,1 hingga 56,3% dalam lima penelitian dan satu penelitian melaporkan hasil sebesar 0% (hanya lima pasien yang menderita nefropati yang tidak diketahui asalnya di kohort 204 pasien). Tabel 3 memberikan gambaran dampak klinis diagnosis genetik yang disoroti oleh berbagai penelitian, dibagi menjadi dampak diagnostik, dampak terapeutik, dan dampak prognostik.

GAMBAR 1 Hasil diagnostik lintas kategori penyakit. (a) Hasil diagnostik per kategori penyakit. Pembagian fenotipe spesifik dalam kelompok "fenotipe penyakit ginjal campuran" tidak ditambahkan ke kelompok penyakit terpisah yang sesuai karena karakteristik pasien/tes/kohort tidak tersedia per fenotipe dalam penelitian pada kelompok ini. Di antara tanda kurung jumlah studi yang disertakan. (b) Hasil diagnostik hanya berdasarkan deteksi variasi nomor salinan (CNV). Di antara tanda kurung jumlah penelitian yang melakukan analisis CNV. (c) Persentase hasil diagnostik keseluruhan (a) dijelaskan oleh CNV (b). Di antara tanda kurung jumlah total studi. Ini adalah rasio antara subpanel (b) dan (a), yang menunjukkan seberapa besar kontribusi pengujian CNV terhadap hasil diagnostik per studi

3.1|Karakteristik yang mempengaruhi hasil diagnostik

3.1.1|Karakteristik pasien

Melihat karakteristik pasien yang mempengaruhi hasil diagnostik dalam penelitian tertentu, kami menemukan bahwa beberapa penelitian melaporkan dampak positif pada hasil diagnostik berdasarkan riwayat keluarga yang positif (n=18 penelitian), hubungan kekerabatan (n=12), ekstrarenal fitur (n=16), timbulnya penyakit dini (n=14), dan ESKD (n=8) seperti dijelaskan pada Tabel 2 dan Tabel Tambahan 1. Beberapa fitur tambahan juga disebutkan , seperti fenotip spesifik, kekambuhan pasca transplantasi yang lebih rendah, dan kurangnya respons terhadap imunosupresif untuk fenotip NS (SRNS) yang resistan terhadap steroid (Tabel 2).

Ketika kami menilai variabel-variabel yang sama (riwayat keluarga, gambaran ekstrarenal, timbulnya penyakit dini, dan ESKD) di antara penelitian, kami dengan jelas melihat bahwa dalam kohort dengan persentase kasus keluarga yang tinggi dan dalam kohort dengan persentase kasus ekstrarenal yang tinggi, diagnostik hasil lebih tinggi (Gambar 2a,b). Namun, kami tidak melihat pola jelas yang sama pada kelompok dengan persentase kekerabatan yang tinggi atau persentase ESKD yang tinggi (Gambar 2c,d). Ketika kami melihat kohort dengan persentase kasus dewasa yang tinggi, kami menemukan persentase hasil diagnostik yang rendah dan tinggi (Gambar 2e). Pada kohort yang tidak memiliki (0%) kasus dewasa, kami melihat hal yang sama, dengan sebagian besar penelitian dengan hasil rendah dijelaskan oleh kelompok CAKUT. Pentingnya analisis CNV disorot pada Gambar 2f di mana hasil diagnostik yang tinggi terlihat pada penyakit yang menyerang anak-anak dibandingkan dengan penyakit yang menyerang orang dewasa.

3.1.2|Karakteristik kelompok

Pada Gambar 3a, kami menunjukkan jumlah pasien yang diuji dalam suatu kohort sehubungan dengan hasil diagnostik. Kami menemukan bahwa hasil diagnostik menurun pada kelompok yang lebih besar. Ketika kita membandingkan diagram kotak yang mewakili hasil diagnostik dalam kohort klinis versus kohort penelitian, tampaknya tidak ada perbedaan yang jelas (Gambar 3b). Kami menggunakan hasil diagnostik dalam kohort klinis yang diuji dan bukan kohort yang diekstrapolasi, karena data tidak selalu tersedia untuk kohort yang diekstrapolasi.

3.1.3|Karakteristik tes Gambar 4 mewakili karakteristik tes antar penelitian. Tampaknya semakin tinggi jumlah gen yang dianalisis, semakin rendah hasil diagnostiknya (Gambar 4a). Ketika menghubungkan pendekatan pengurutan dengan hasil diagnostik, kami menemukan bahwa pengujian gen tunggal memiliki hasil diagnostik yang lebih rendah dibandingkan ketika beberapa gen (2–10) diuji, dan kami menemukan hal yang sama dengan panel gen kecil (<100) versus large gene panels (Supplementary Figure 1). However, the categories WES/WGS and SNP-array had a lower yield than the previously mentioned categories. 47/115 studies assessed SNVs, 12/115 assessed only CNVs and 55/115 assessed both (Figure 4b). As shown in Figure 4c, we found that the diagnostic yield was highest in cohorts where both SNVs and CNVs were assessed, and lowest in cohorts that only assessed CNVs. We saw that over the years there has been a shift from focusing either on SNVs or CNVs to including both in genetic testing (Supplementary Figure 2). There has also been a shift from enrichment-based panels to an exome-based approach. Noticeably in CNV testing, there is a shift toward the use of MPS-based CNV-calling.

3.1.4|Analisis CNV

CNV paling sering dinilai pada kelompok penyakit CAKUT, ciliopathy, tauopathies, ESKD, dan fenotip penyakit ginjal campuran. Pada nefrolitiasis/urolitiasis, CNV tidak pernah dinilai. Hasil diagnostik hanya berdasarkan pengujian CNV tertinggi pada pasien CAKUT, diikuti oleh kelompok penyakit dengan fenotipe campuran dan ciliopati. Kontribusi CNV terhadap hasil diagnostik juga tertinggi pada kelompok CAKUT dan ciliopati. Ketika penelitian menilai CNV dan SNV, kami menemukan persentase CNV tertinggi pada CAKUT dan tauopathies (Gambar 1c). Penghapusan HNF1B yang menyebabkan tubulopati Gitelman (seperti) menjelaskan tingginya persentase CNV pada tubulopati terakhir. Berbagai pendekatan pengujian CNV digunakan, dengan hasil tertinggi diperoleh dari pengujian gen tunggal dan pengujian CNV berbasis array (Gambar Tambahan 3).

3.2|Gen inti

Dalam semua penelitian yang disertakan, sejumlah gen bertanggung jawab atas sebagian besar kasus yang dijelaskan seperti yang ditunjukkan pada Gambar 5. Kami menemukan bahwa maksimal 10 gen bertanggung jawab atas setidaknya 50% kasus yang terselesaikan dan seringkali hanya satu hingga empat kasus. gen yang bertanggung jawab. Pada kelompok fenotipe ADTKD dan APDKD, hanya satu gen (masing-masing UMOD atau MUC1 dan PKD1) yang bertanggung jawab atas 50% hasil yang dilaporkan dalam satu penelitian. Namun juga pada kelompok fenotip dengan fenotip penyakit ginjal yang beragam, kami menemukan bahwa varian pada maksimal 10 gen dikaitkan dengan 50% hasil diagnostik. Gen yang bertanggung jawab atas hasil tertinggi sebesar 50% ditampilkan di panel (b). Detail per studi dapat ditemukan di Tabel Tambahan 3.

GAMBAR 2 Plot sebar menunjukkan hubungan antara hasil diagnostik dan karakteristik pasien. Legend menjelaskan sejumlah penelitian yang data mengenai karakteristik pasien spesifik ini tersedia. Warna menunjukkan kelompok penyakit asal penelitian. Setiap titik mewakili untuk satu penelitian berapa persentase fitur tertentu dalam kelompok tersebut dan hasil diagnostik apa yang diperoleh dari penelitian yang sama. (a) Persentase kasus dengan riwayat keluarga positif sehubungan dengan hasil diagnostik. (b) Persentase kasus dengan gambaran ekstrarenal sehubungan dengan hasil diagnostik. (c) Persentase kasus dari keluarga sedarah sehubungan dengan hasil diagnostik. (d) Persentase kasus penyakit ginjal stadium akhir (ESKD) sehubungan dengan hasil diagnostik. (e) Persentase kasus dengan timbulnya penyakit pada orang dewasa sehubungan dengan hasil diagnostik. (f) Persentase kasus dengan timbulnya penyakit pada orang dewasa sehubungan dengan hasil diagnostik hanya berdasarkan variasi jumlah salinan (CNV).

Layanan Pendukung:

Surel:wallence.suen@wecistanche.com

Whatsapp/Telp:+86 15292862950

Toko:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop